山東財經大學在職研究生教育有應用經濟學、工商管理、管理科學與工程等6個一級學科碩士學位授予權,有47個二級學科碩士學位授權點(10個專業碩士非全日制研究生授權點含MBA)。會計學、管理科學與工程、企業管理、金融學、數量經濟學、政治經濟學6個學科為省級重點學科。